1株牛源A型多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及全基因组测序分析

摘要

采集一病牛鼻咽拭子和组织病料,并进行细菌分离纯化、16S rRNA基因扩增、荚膜血清型分型、毒力基因检测和分离株全基因组测序。结果显示,经细菌分离纯化、生化试验及PCR鉴定发现1株A型多杀性巴氏杆菌菌株,命名为“Pm WZ01”株;毒力基因扩增发现Pm WZ01基因组含有tadD、nanH、ompA、exbB、exbD、fur基因;基因组测序获得Pm WZ01株全基因组大小为2 383 021 bp,GC含量为40.28%;含有56个tRNA、19个rRNA;155个假基因,3个基因岛,5个前噬菌体,55个碳水化合物活性酶基因;CARD注释分析发现1个PBP3抗性基因和2个EF-Tu抗性基因;VFDB和PHI-base注释分析发现582个毒力因子相关基因及888个表型突变基因。系统进化树分析发现Pm WZ01菌株与中国长春Pm-3菌株(CP014618.1)、英国P1933菌株(CP132898.1)以及中国湖北HB01菌株(CP006976.1)属于同一分支,进化关系最近。本研究完成了1株A型多杀性巴氏杆菌的分离鉴定以及生物学特性和全基因组测序分析,为牛源A型多杀性巴氏杆菌病的防控研究提供了理论依据。

关键词

多杀性巴氏杆菌 / 牛源 / 全基因组测序 / 耐药性 / 毒力