云南省山羊地方性鼻内肿瘤病毒全基因组序列的测定及分析

摘要

对云南省山羊地方性鼻内肿瘤病毒(enzootic nasal tumor virus of goats, ENTV-2)全基因组进行测定及分析。结果显示，成功获得ENTV-2 YN2023毒株全基因组序列(GenBank登录号：PP682590.1),YN2023毒株全基因组长为7 307 bp,具有5′-Μ5-gag-pro-pol-env-Μ3-3′典型结构；全基因组序列同源性分析表明，YN2023毒株与41株参考毒株的核苷酸同源性为85.3%～95.5%;全基因组进化树表明，YN2023毒株与中国流行毒株亲缘关系较近，具有一定的遗传多样性和地理聚集性；gag基因进化树分析结果显示，YN2023毒株gag基因聚类在ENTV-2 gag基因的一个分支上，YN2023与enENTV-FJ1、GDQY2017毒株聚类在同一个小分支，亲缘关系最近；env基因进化树表明，YN2023与GDQY2017、GDZJ2022、ENTV-2CHN1-6、ENTV-FJ1、ENTV-FJ3在同一个分支上，并且与GDQY2017同为一个分支，亲缘关系较近；重组分析结果显示，YN2023毒株在断点位置6 378～7 478 bp之间发生了以中国重庆毒株enENTV-CQ1(OR669623.1)为主要亲本、以中国四川毒株BH(MT254062.1)为次要亲本的潜在重组事件。本试验结果丰富了云南省ENTV-2型毒株基因组信息，并为ENTV-2在云南省的遗传变异情况提供数据支持。

关键词

山羊地方性鼻内肿瘤病毒 / 全基因组 / 序列分析 / 进化树分析