猪血凝性脑脊髓炎病毒NS2蛋白的结构与功能分析

摘要

猪血凝性脑脊髓炎病毒(porcine hemagglutinating encephalomyelitis virus,PHEV)是猪群易感冠状病毒之一,基因组编码的非结构蛋白2(NS2)在病毒流行传播过程中经常发生缺失,但其生物学意义尚不明确。为了探究NS2蛋白的结构和功能,本研究利用ProtParam、TMHMM、NetPhos3.1、ExPASy等平台分析其理化性质、空间结构、遗传进化及翻译后修饰特征,同时真核表达NS2蛋白并进行转录组测序,明确其参与的生物学过程。结果显示,NS2蛋白由233个氨基酸组成,相对分子质量26.735 kDa,在哺乳动物中的半衰期约30 h,包括13个磷酸化位点、2个N-糖基化位点和1个O-糖基化位点,无信号肽,亲水性较强;NS2中α-螺旋占比最高(43.78%),其次是无规则卷曲(36.05%);NS2蛋白在我国东北流行毒株PHEV-CC14和PHEV-JL/2008之间的同源性为99.57%;NS2蛋白广泛参与神经相关功能的调控,如轴突导向、突触发育。本研究初步明确了NS2蛋白的生物学功能,为解析PHEV致病机制提供了新视角。

关键词

猪凝血性脑脊髓炎病毒 / NS2蛋白 / 生信分析 / 真核表达 / 转录组测序 / 结构功能