2022年中国部分地区鹅星状病毒新出现变异毒株及流行毒株的分子特征

摘要

鹅星状病毒(GAstV)已成为危害我国养鹅产业的重要病原之一,为研究2022年我国部分地区新出现变异毒株及流行毒株基因组信息,揭示其生物学特征,采用分段法对9株GAstV-1和12株GAstV-2临床分离病毒的全基因组进行测序分析。基因结构分析结果显示,编码区基因大小为6 977～7 215 bp,其开放阅读框1((ORF1)均含有丝氨酸蛋白酶、核定位信号(NLS)、RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)的特征基序。其核糖体移码信号(RFS)均为茎环结构,但GAstV-1的茎秆和环状茎叶为“14+11”核苷酸构型,GAstV-2为“12+14”构型,且GAstV-2茎叶为“8+6”双环构型。与禽星状病毒1、2、3型(AAstV-1、AAstV-2、AAstV-3)代表毒株比对分析结果显示:GAstV-1分离毒株ORF1 b编码蛋白氨基酸序列同源性介于7%～64%之间,GAstV-2分离株同源性介于8%～68%之间;GAstV-1分离毒株ORF2编码蛋白氨基酸序列与AAstV-1、AAstV-2、AAstV-3的平均遗传距离分别为0.9、1.3、0.9,而GAstV-2分离毒株分别为1.0、1.3、0.7。ORF2编码蛋白的B细胞构象抗原表位分析结果显示:GAstV-1分离株有4个共同表位,分别为PRE、LALQSQSVNTFA、AAG、YQQVTSDQSI,但G1FJ267、G1JS277两株病毒均在N145、N287、N314存在差异表位;GAstV-2分离株有7个共同表位,分别为NQE、RAN、GPE、PRQ、TRAQ、SNS、AVPPNTPL,但G2FJ283-3B株在N83、N136、N331、N351存在差异表位。研究结果表明:21株GAstV临床分离毒株与已知AAstV为不同种类,属于新型AAstV,且毒株间致病性存在多样性;GAstV-1与GAstV-2均存在多个不同的血清型,其可能存在的血清亚型还有待血清学试验进一步验证。

关键词

鹅星状病毒 / 禽星状病毒 / 抗原表位 / 遗传多样性