浙南地区PEDV流行病学调查及病毒演变分析

摘要

为了解浙江南部地区猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea, PED)的流行情况及其分子特征，本研究收集了2023—2024年浙江南部4个地区共计90份腹泻样本，进行了猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行病学检查，并测定了1株强阳性毒株的病毒全基因组序列、分析其基因组和遗传进化特征及其基因重组事件；同时，预测了PEDV S蛋白糖基化和棕榈酰化位点及分子建模。结果显示，PEDV在浙江地区的阳性率为50%左右。所测序的PEDV ZJLS2023株为GⅡa型毒株，与GⅡa型毒株基因同源性在98%以上。基因重组事件分析结果显示，PEDV ZJLS2023株可能由AH2012和SC2021毒株重组进化而来，在12 537～27 339 nt基因范围内广泛发生重组事件。N链糖基化预测结果显示，ZJLS2023株具有特定的糖基化位点NTTI,并且S蛋白分子建模结果进一步揭示，ZLJS2023毒株在中和表位区域存在多个氨基酸突变位点S525C、N527K、D533N、F539L、N566K和D608E。综上所述，本研究揭示了浙江地区PEDV的流行现状和病毒遗传进化特征，为浙江地区的PEDV防控提供了参考依据。

关键词

猪流行性腹泻病毒 / 遗传进化分析 / RDP4 / 糖基化 / 分子模型