1株PRRSV-1的分离鉴定及遗传变异分析

摘要

为探究欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV-1)在我国的流行特征与遗传进化规律，本研究对2023年广西某猪场疑似PRRS临床样本进行RT-PCR检测。筛选出PRRSV-1阳性样品，经接种猪肺泡巨噬细胞，成功分离获得1株PRRSV-1毒株(命名为GXGG20230626)。对该毒株全基因组进行扩增、克隆与序列比较分析，结果显示，该毒株全基因组长度为14 964 nt(不包括polyA尾),与PRRSV-1经典毒株(Lelystad virus)以及泰国分离株01CB1的核苷酸序列相似性分别为89.9%和89.8%。值得注意的是，GXGG20230626 nsp2蛋白存在独特的缺失模式(281～300 aa和323～340 aa),其GP5蛋白中和表位也与我国PRRSV-1主流亚群不同。结合国内外PRRSV参考毒株序列进行遗传进化分析比较系统进化分析显示，GXGG20220626属于PRRSV-1亚型1毒株，独立于我国现有PRRSV-1流行毒株，形成了新的进化亚群。重组分析结果显示该毒株为非重组病毒。结果表明，我国存在PRRSV-1新型独立进化亚群，揭示了PRRSV-1在我国的持续进化动态，为PRRSV的分子流行病学监测和疫苗研发提供了理论依据。

关键词

PRRSV-1 / 分离鉴定 / 全基因组测序 / 遗传进化分析