西南地区PSV和PKV的遗传进化分析及双重RT-qPCR方法的建立

曾程; 付利芝; 严楠; 王玉娥

doi:10.16303/j.cnki.1005-4545.2026.06.01

中国兽医学报 ›› 2026, Vol. 46 ›› Issue (6) : 1189 -1199. DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2026.06.01

西南地区PSV和PKV的遗传进化分析及双重RT-qPCR方法的建立

曾程, 付利芝, 严楠, 王玉娥

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摘要

收集2022-2025年我国西南地区22个养殖场共计206份腹泻仔猪的肠组织样本及粪便样本，利用RT-PCR方法对猪萨佩罗病毒(porcine Sapelovirus, PSV)和猪库布病毒(porcine Kobuvirus, PKV)进行检测，通过分析PSV和PKV的关键基因和全基因组特征，探究其遗传进化规律；同时，建立检测PSV和PKV的双重RT-qPCR方法。结果显示，PSV阳性率为32.52%(67/206),成功获得11条PSV VP1基因序列，遗传进化分析结果显示本试验中的PSV毒株分为4个不同的分支；同时，成功获得3条PSV的基因组序列，重组分析发现其中的2株PSV存在重组事件，PSV/CHN/SW-1/2023株可能发生重组的区域为1～1 393 nt以及6 503～6 999 nt, PSV/CHN/SW-2/2023株可能发生重组的区域为888～2 768 nt; PKV阳性率为18.90%(39/151),成功获得9条PKV VP1基因序列，遗传进化分析结果显示本试验的PKV毒株序列均与目前中国流行毒株PKV/CHN/SH-W/2010聚为一支；同时，基于PSV和PKV的3D基因成功建立了检测PSV和PKV的双重RT-qPCR方法，验证结果表明该方法的稳定性和特异性较好。结果表明，PSV和PKV在我国西南地区已经流行，并且具有丰富的遗传多样性。