1株羊源伪结核棒状杆菌的分离鉴定及其全基因组序列分析

摘要

通过羊源伪结核棒状杆菌(Corynebacterium pseudotuberculosis,CP)的分离鉴定和PacBio三代测序方法对疑似病料进行细菌分离鉴定和细菌完成图测序，并对细菌基因组序列进行生物信息学分析。结果显示，分离株在血琼脂平板上生长状态良好，菌落呈黄白色、不透明样，在普通营养琼脂和普通营养肉汤内生长不良，革兰染色呈紫色棒状菌。生化试验结果显示，分离菌株葡萄糖、尿素试验呈阳性，乳糖、麦芽糖、甘露醇、蔗糖、西蒙氏枸橼酸盐、硫化氢、靛基质、硝酸盐还原试验、甲基红(MR)试验和V-P试验均呈阴性。16S rRNA序列比对结果显示，分离菌与NCBI数据库中已公布的CP 16S rRNA基因序列相似性均>99%,鉴定该菌株为CP。测序结果显示，CP-YN株基因组全长为2 338 599 bp,共预测到2 191个基因。NR数据库共注释到21个同源物种；GO数据库注释到参与生物学途径基因有22个，细胞组分基因有16个，分子功能基因有13个；KEGG代谢通路共注释到14个通路；Swiss-Prot数据库注释到51个基因的蛋白序列功能。结果表明，通过对分离菌株CP-YN株进行细菌完成图测序，成功获得羊源CP的基因组全长，并进行基因组组分分析和基因功能注释，能深入了解细菌基因组特性、揭示其遗传多样性、致病机制和耐药性机制，为研究和应对羊源CP引起的疾病提供重要的基础数据支持。

关键词

羊源伪结核棒状杆菌 / 分离鉴定 / 全基因组测序 / 功能分析

基金资助

西藏自治区“十四五”重大科技专项资助项目（XZ202101ZD0001N）