转录组学分析二氢杨梅素对鸡白痢沙门菌的抑制作用机制

摘要

将质量浓度为最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration, MIC)的二氢杨梅素(dihydromyricetin, DMY)处理的鸡白痢沙门菌(Salmonella pullorum,S.pullorum)进行转录组测序，分析MIC的DMY对S.pullorum的抑制作用机制。采用微量肉汤稀释法测定DMY对S.pullorum的MIC为625.000 mg/L,使用含质量浓度为MIC的DMY的LB肉汤培养基处理试验组菌株，利用转录组测序(RNA-sequencing, RNA-Seq)技术进行差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)鉴定、GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。以MIC的DMY作用后，共有1 021个基因的表达量发生显著变化，其中有430个基因表达量上调，591个基因表达量下调；DMY处理组富集到的34条KEGG子类功能中，代谢方面富集到11条子类功能；KEGG富集通路分析后，核糖体通路和硫代谢通路所富集的基因数量最多，差异基因主要分布在核糖体通路、硫代谢通路、丙酮酸代谢通路、三羧酸循环通路、抗坏血酸和醛酸代谢通路。DMY能够通过调节核糖体通路、硫代谢通路、丙酮酸代谢通路、三羧酸循环通路、抗坏血酸和醛酸代谢通路中关键基因的表达对S.pullorum的生长产生抑制作用，表明DMY的抑菌作用是针对细菌的生长、能量代谢和应激反应，为后续确定该药物的作用靶点提供基础。

关键词

鸡白痢沙门菌 / 二氢杨梅素 / 最小抑菌浓度 / 转录组 / 实时荧光定量PCR

基金资助

国家自然科学基金青年科学基金资助项目（32202816）; 国家重点研发计划资助项目（2022YFD1800400）; 湖北省技术创新计划资助项目（2024BBB074,2024BBA004）; 湖北省现代农业产业技术体系资助项目（2023HBSTX4-04）; 国家肉鸡产业技术体系资助项目（CARS-41）