基于CAPTURE技术筛选猪NANOG基因启动子区域上游调控因子

摘要

对多能性网络调控核心枢纽NANOG基因表达调控的研究，有助于更好地揭示猪早期胚胎发育过程中细胞因子网络的调控机制及分离后干细胞多能性的维持机制。本研究使用5′-RACE确定猪NANOG基因的转录起始位点及启动子区域，然后利用2个CAPTURE系统分别筛选出与启动子区域特异结合的蛋白质，从2系统共同筛选出的转录因子中选取OCT4和TBX3进行双荧光素酶分析，以及OCT4基因敲低试验进行验证。结果显示：定位猪NANOG基因转录起始位点对应5号染色体基因组区域CHR5:62931642及其启动子区域；筛选出126个猪NANOG基因启动子区域特异性的候选上游调控因子，并验证了其中的OCT4和TBX3与该启动子区域结合的特异性。CAPTURE技术筛选出的126个上游调控因子可能与猪NANOG基因启动子区域特异结合、调控其表达，其中一些调控具有种属特异性；CAPTURE技术具有很高的特异性和可信度，适合应用于猪早期胚胎基因表达调控的研究；OCT4和TBX3可以作为上游调控因子，特异地与猪NANOG启动子区域结合并促进NANOG表达。

关键词

NANOG / CAPTURE / 转录因子 / 早期胚胎发育 / 猪

基金资助

国家自然科学基金资助项目(82012000,32470860); 国家重点研发计划资助项目(2024YFA1802403)