1株羊源非典型肠致病性大肠杆菌的分离鉴定及全基因组测序与分析

摘要

为探究甘肃省天水地区某养殖场羊腹泻的病原，本研究开展病原的分离鉴定、药敏试验、基因组测序与分析，以及基因组平均遗传相似度与系统发育树分析，旨在阐明该病原的生物学特性、致病机制和耐药性，从而为羊养殖过程中相关疾病的防控提供科学依据。结果显示从腹泻羊的肠道组织中分离出1株肠致病性大肠杆菌(enteropathogenic Escherichia coli,EPEC),命名为“TS2024”。该菌株对氨苄西林、哌拉西拉和四环素抗生素表现出耐药性，与全基因组耐药基因筛选结果一致。通过VFDB比对，YZ2024分离株携带多种毒力基因，主要包含Ⅵ型分泌系统、运动性、黏附、侵袭、毒素和免疫调节等相关的毒力基因。分离菌株TS2024与41株参考菌株的基因组平均遗传相似度在95%～99%之间，与EHEC菌株str12009的基因组平均遗传相似度值最高。构建的全基因组系统发育树表明，TS2024分离株与EHEC菌株str12009在遗传关系上属于同一分支，具有较近的同源关系。本研究为理解羊源EPEC的生物学特性、致病机制和耐药性提供理论基础，并为其感染的临床治疗提供重要的科学依据。

关键词

EPEC / 分离鉴定 / 基因组测序 / 毒力基因 / 耐药基因

基金资助

甘肃省自然科学基金项目（23JRRA1410）; 甘肃省教育厅青年博士基金项目（2022QB-089）; 2025年甘肃动物疫病监测项目