基于细胞色素P450通路的前列腺癌差异关键基因的筛选与验证

摘要

目的：研究细胞色素P450与前列腺癌的相关性，通过生物信息挖掘发现细胞色素P450通路与前列腺癌发生发展相关的重要节点。方法：基于3套（GSE46602、GSE32571、GSE70768）前列腺癌数据集筛选差异表达基因，比较关键基因在前列腺癌和正常组织的差异，再结合蛋白表达及病理评分筛选出与前列腺癌发生发展相关联的3个关键节点，并用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)进行实验验证。结果：3套全基因组表达谱整合分析找到P450相关的通路存在ALDH3B2、GSTP1、CYP3A5、GSTM1、GSTM5、GSTM2、MGST3等7个差异表达基因（P<0.05,LogFC<-0.5或LogFC>0.5）。结果发现不同Gleason分级仅与其中的6个基因的m RNA表达有相关性（P<0.05）。蛋白表达分析结果显示GSTP1、GSTM1、GSTM5这3个基因的前列腺癌和癌旁组织的蛋白表达差异具有统计学意义（P<0.05）。RT-qPCR验证发现，与前列腺癌旁正常细胞RWPE-1相比，GSTM1和GSTP1在不同的前列腺癌细胞（DU145、C4-2、LNCaP）中mRNA表达下降。GSTM5表达虽然明显降低但差异无统计学意义（P>0.05）。结论：通过多套数据在m RNA和蛋白质表达水平上整合分析发现，P450相关的药物代谢—细胞色素P450通路和细胞色素P450对外来异物的代谢通路与前列腺癌的发生发展存在紧密相关。

关键词

生物信息学 / 前列腺癌 / 差异表达基因 / 细胞色素P450