miR-499a-5p在骨肉瘤中的表达及其对骨肉瘤发生发展的影响

摘要

目的：探讨miR-499a-5p在骨肉瘤（OS）中的表达及其对OS发生发展的影响。方法：通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证miR-499a-5p在OS细胞系（143B、MNNG）及正常成骨细胞（hFOB1.19）中的差异表达，并使用3种在线预测工具对miR-499a-5p的靶基因进行了预测，并取3种数据共同交集得到的靶基因作为候选靶基因。利用靶基因进行基因功能分析（GO）富集分析，并利用京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，然后经过蛋白互作网络（PPI）分析，筛选节点最高的3个关键hub基因，并利用生存分析从这3个关键hub基因中筛选出具有预后意义的关键基因。结果：RT-qPCR结果显示，与正常的成骨细胞比较，OS细胞中miR-499a-5p表达降低（P<0.05）。通过3种在线预测工具预测miR-499a-5p的靶基因并交集获得181个靶基因。GO分析结果表明，生物过程（BP）最显著富集的是RNA聚合酶Ⅱ促子转录的正向调控，细胞组成（CC）最显著富集的是细胞核，分子功能（MF）最显著富集的是蛋白结合。在KEGG的通路富集中，最显著的是人类T细胞白血病病毒1感染信号通路，其次是轴突引导通路、催产素信号通路和T细胞激活信号通路。靶基因的蛋白互作网络分析发现节点最高的3个关键hub基因分别是异质核糖核蛋白C(HNRNPC)、真核翻译起始因子4γ2(EIF4G2)和真核翻译起始因子4A同工型2(EIF4A2)。生存分析结果显示，高度表达HNRNPC的OS患者的生存率显著降低（P<0.05）。结论：miR-499a-5p可能通过调控HNRNPC基因对OS发展产生潜在的影响。

关键词

骨肉瘤 / 生物信息学 / miR-499a-5p / 异质核糖核蛋白C

基金资助

国家自然科学基金资助项目（No.82160418）; 广西自然科学基金资助项目（No.2019GXNSFAA185004）