定量蛋白质组学分析SDF2L1过表达后鼻咽癌细胞中的差异蛋白

摘要

目的：分析基质细胞衍生因子2样1(SDF2L1)过表达对人鼻咽癌（NPC）细胞5-8F中蛋白表达谱的影响。方法：提取SDF2L1基因过表达细胞株（5-8Fg）及空载细胞株（5-8F1）的总蛋白，利用非标记定量（LFQ）蛋白组学技术和串联质谱分析技术筛选差异表达蛋白（DEPs），应用R软件对DEPs进行GO和KEGG富集分析，Cytoscape软件筛选关键的DEPs,Oncomine数据库对关键DEPs进行验证，RT-qPCR和western blotting法对筛选出来的关键DEPs进行验证。结果：在5-8Fg细胞中共筛选出730个DEPs，其中296个DEPs上调，434个DEPs下调。富集分析结果显示，DEPs主要定位在核糖体中，参与核糖体合成和内质网蛋白加工等过程，发挥黏附蛋白和催化活性等功能。通过Cytoscape和Oncomine数据库验证出核糖体蛋白L14(RPL14)、RPS15A等9个关键DEPs。SDF2L1过表达后RPL14基因（P<0.05）表达下调。结论：SDF2L1过表达后显著改变了NPC细胞中的蛋白表达特征，RPL14可能是NPC的促癌因子。

关键词

SDF2L1 / 鼻咽癌 / 非标记定量蛋白质组学 / 生物信息学