肝细胞癌差异表达的癌—睾丸抗原筛选及表达初步验证

摘要

目的：通过生物信息学方法筛选肝细胞肝癌（HCC）相关癌—睾丸抗原（CTA）并进行实验验证，为HCC免疫靶向治疗奠定基础。方法：通过GEPIA数据库筛选HCC中显著差异表达CTA，再用LinkedOmics数据库分析这些CTA与HCC预后的关系，并获取与这些CTA正相关的共表达基因集，进一步用DAVID数据库对这些CTA进行功能分析。共收集32例HCC组织，选择其中10例配对癌旁组织，通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测CTA mRNA表达。结果：通过生物信息学的方法，筛选出HCC中5个显著差异表达且与预后相关的CTA:NUF2、PBK、KIF2C、OIP5和SPA17；进一步对这5个CTA进行功能预测，发现它们主要参与转录及其调控、细胞分裂、纤毛形态发生等生物学过程，涉及细胞周期、剪接体及RNA运输等信号通路。RTqPCR结果显示，NUF2和PBK在HCC组织中的表达显著高于癌旁组织。结论：CTA NUF2和PBK高表达于HCC，有望成为HCC潜在的治疗靶点。

关键词

肝细胞癌 / 癌睾丸抗原 / 生物信息学分析

基金资助

国家自然科学基金资助项目（No.81860445;No.81960453,No.82060387）; 广西自然科学基金资助项目（No.2018GXNSFAA281251;No.2018GXNSFAA050151;No.2018GXNSFAA281050;No.2018GXNSFAA281240）