基于转录组测序分析并验证胫骨横向骨搬移术治疗糖尿病足患者外周血的miRNA

摘要

目的：对经胫骨横向骨搬移术治疗糖尿病足患者的外周血进行转录组测序，利用生物信息学分析并验证差异显著的miRNA，探究治疗促进创面愈合可能的机制。方法：通过转录组测序，获取了miRNA的表达数据，随后进行差异表达、靶基因预测和功能富集分析，最后进行临床样本的实时荧光定量聚合酶链式反应（RT-qPCR）验证。结果：经过差异表达分析，发现差异表达显著的hsa-miR-103a-3p上调。预测得其109个靶基因主要与发芽血管的调控，大分子代谢过程负调控和细胞蛋白修饰过程等生物学过程相关，以及AMPK信号通路相关。而靶基因中经MNC算法获得前10的核心基因为AGO1、CDK6、TNRC6B、DICER1、CAPZA2、KIF23、KIF5A、MTMR3、MTMR4、PIK3R1；验证临床样本结果得出，TTT组的hsa-miR-103a-3p相对表达量比对照治疗组相比升高3.7倍（P<0.001）。结论：hsa-miR-103a-3p在胫骨横向骨搬移术治疗糖尿病足患者过程中表达上升，可能是手术治疗促进伤口愈合和血管生成的效应miRNA之一。

关键词

转录组测序 / 胫骨横向骨搬移术 / 生物信息学分析 / 伤口愈合 / 糖尿病足

基金资助

国家自然科学基金资助项目（No.82060406）; 广西重点研发计划资助项目（No.2021AB11027）; 青秀区科技计划资助项目（No.81373498）; 广西医科大学第一附属医院临床研究攀登计划资助项目（No.YYZS2020010）