KTN1在肾透明细胞癌中的表达及临床意义

doi:10.16190/j.cnki.45-1211/r.2022.10.004

广西医科大学学报 ›› 2022, Vol. 39 ›› Issue (10) : 1542 -1549. DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2022.10.004

作者信息 +

Author information +

文章历史 +

PDF (2979K)

摘要

目的：探索激动素1(KTN1)在肾透明细胞癌（KIRC）中的表达变化和临床意义。方法：利用TCGA数据库中533例KIRC组织以及72例正常对照组织转录组数据，分析KTN1在KIRC中mRNA表达变化，及其与患者临床病理指标的相关程度和生存时间的关联，并分析KTN1 mRNA表达水平作为KIRC的诊断效能；利用GEO数据库对662例KIRC组织样本和268例正常对照组织样本进行KTN1 m RNA表达水平的meta分析；采用实时荧光定量聚合酶链式反应（RT-qPCR）检测KTN1在KIRC细胞系以及组织中的转录水平；利用UALCAN数据库分析KTN1蛋白表达水平及其启动子区甲基化修饰水平；GSEA软件用于通路富集。结果：与正常对照组织比较，KIRC中KTN1 mRNA表达降低（P<0.05）。TCGA数据库分析发现，在远处器官转移、淋巴结转移以及Ⅲ～Ⅳ期患者中KTN1 mRNA表达水平较低（均P<0.05）。生存分析显示KIRC患者中KTN1低表达组预后不良（P=0.008）。分别基于TCGA数据库和RT-qPCR结果绘制受试者工作特征曲线（ROC），发现曲线下面积（AUC）为分别为0.931(95%CI:0.894～0.948,P<0.001)和0.867(95%CI:0.727～1.000,P<0.001)。KIRC中KTN1启动子区域的甲基化水平高于正常对照组织（P<0.01），经5-aza-dC去甲基化处理后，KIRC细胞的KTN1 mRNA表达上调（P<0.01）；通路富集结果发现KTN1与异体移植排斥反应、干扰素γ反应等22个通路有关。结论：在KIRC中KTN1因高甲基化导致转录失活，并提示患者的不良预后，KTN1可能是KIRC潜在的诊断和预后分子标志物。