KIF2C在肝细胞癌中的作用及ceRNA调控网络构建

摘要

目的：分析驱动蛋白家族成员2C(KIF2C)在肝细胞癌（HCC）中的表达及意义；探索竞争内源性RNA(ceRNA)网络在HCC发展中的潜在作用。方法：利用肿瘤芯片数据库（Oncomine）、肿瘤基因组图谱（TCGA）和基因表达谱交互分析（GEPIA）数据库分析KIF2C在HCC中的表达，及其与HCC的总生存期（OS）、无病生存期（DFS）及病理分级等临床参数的关系；通过RT-qPCR实验分析KIF2C在HCC组织和配对的癌旁组织中的表达；通过细胞功能实验分析干预KIF2C表达对HCC细胞增殖、侵袭与迁移的影响；利用STRING和GeneMANIA数据库探索与KIF2C互作的蛋白和基因；使用高通量测序，寻找log2|FC|>1条件下的差异基因，并进行GO与KEGG富集分析，探索KIF2C潜在的作用通路；通过共表达分析，筛选互作的RNA后构建ceRNA调控网络。结果：KIF2C在HCC中显著高表达（P<0.001）;KIF2C表达水平影响HCC患者的生存预后及病理分级（P<0.05）；细胞功能实验表明KIF2C过表达促进HCC细胞的增殖、侵袭与迁移（P<0.05）；有10个蛋白参与KIF2C的蛋白互作；共有20个基因参与KIF2C的基因互作；筛选出3 754个长非编码RNA、7 621个差异表达信使RNA和170个差异表达微小RNA;GO与KEGG富集分析显示，相关差异基因参与细胞外囊泡、质膜固有成分等功能，且显著富集于p53信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路；最后，12个lncRNA和5个miRNA构成了一个ceRNA网络，其中has-miR-181b-5p是关键的miRNA。结论：KIF2C在HCC中显著高表达且提示预后不良，KIF2C过表达促进HCC细胞的增殖、侵袭和迁移活动；获得与KIF2C相关的ceRNA调控网络，其在HCC中发挥重要作用。

关键词

肝细胞癌 / KIF2C / 内源竞争性RNA

基金资助

国家自然科学基金资助项目（No.81860504）; 广西自然科学基金资助项目（No.2018 GXNSFBA138013）; 广西重点研发项目资助（No.GKEAB18221019）