2012—2022年广西HIV-1独特重组型毒株近似全长基因序列特征分析

摘要

目的：研究广西HIV-1独特重组型毒株（URFs）的基因重组特点，为广西HIV-1疫情防控提供科学依据。方法：对1例pol区基因序列初步判断为URF的HIV-1感染者的血液样本进行RNA提取、巢式PCR扩增全长基因并测序，从PubMed等数据库检索2012—2022年发表的有关广西URFs近似全长基因组的文章及对应的序列，构建系统进化树，并进行重组模式、断点分析和耐药突变位点分析。结果：测序获得1例长度约8.9 kb的URF，该URF是以CRF08＿BC为骨架插入CRF01＿AE片段构成的二代重组毒株。将该URF与数据库中检索到的12例广西URFs共同分析，发现广西URFs主要来源于性传播途径感染者和静脉吸毒感染者。所有URFs均包含CRF01＿AE片段，以01＿AE/07＿BC重组比例最高（69.2%,9/13）,1例URF含有主要耐药位点。结论：广西已鉴定的URFs数量较少，以01＿AE/07＿BC重组为主，应加强对URFs的监测和鉴定，以全面了解广西HIV-1重组毒株的特点。

关键词

人类免疫缺陷病毒 / 独特重组型毒株 / 重组特征

基金资助

国家自然科学基金资助项目（No.81971934）; 广西重点研发计划资助项目（No.桂科AB18050022）