基于单细胞RNA测序探讨肾SOX9阳性祖细胞转录组特征

吴日宝; 陈良颢; 景子涵; 邹春林

doi:10.16190/j.cnki.45-1211/r.2023.04.015

广西医科大学学报 ›› 2023, Vol. 40 ›› Issue (04) : 624 -630. DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2023.04.015

基于单细胞RNA测序探讨肾SOX9阳性祖细胞转录组特征

吴日宝, 陈良颢, 景子涵, 邹春林

作者信息 +

Author information +

文章历史 +

PDF (4345K)

摘要

目的：基于单细胞RNA测序探究人正常肾脏中SOX9阳性祖细胞的转录组特征，为肾脏再生医学研究提供依据。方法：从GEO数据库中收集已发表的人类正常肾脏的单细胞RNA测序数据，结合差异基因分析、功能富集分析和拟时序分析探究SOX9阳性祖细胞的转录组特征，通过免疫组化实验和免疫荧光实验验证相关分析结果。结果：在人正常肾脏组织中，SOX9阳性细胞主要存在于近端小管中；GO分析结果显示，近端小管中的SOX9阳性细胞仍维持祖细胞样特性；进一步的亚群分析显示，近端小管SOX9阳性细胞可分为C1、C2和C3 3个亚群，其中C2亚群高表达SOX4、HES1、MYC、KLF4等与干细胞状态维持的相关基因，并在SOX9阳性细胞分化轨迹中处于起始位置。结论：人正常肾脏SOX9阳性细胞中仍有一部分细胞维持祖细胞样特性，具有潜在的再生医学研究价值。