不明原因复发性流产中铁死亡的生物信息学分析及验证

摘要

目的：探究铁死亡关键基因在不明原因复发性流产（URSA）发生发展中的作用，初步确定潜在生物标志物。方法：从基因表达综合（GEO）数据库下载数据集GSE26787，利用GEO2R筛选差异表达基因（DEGs）；从FerrDb V2数据库下载铁死亡相关基因；DEGs与铁死亡基因取交集获得URSA铁死亡相关基因；利用DAVID数据库对URSA铁死亡相关基因进行基因本体（GO）富集及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析；利用String数据库和Cytoscape软件分析蛋白互作网络，筛选Hub基因；采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测Hub基因在人工流产组及URSA组患者蜕膜组织中mRNA的表达水平。结果：共筛选出55个URSA铁死亡基因；GO功能富集提示URSA铁死亡相关基因主要在自噬调节、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录正调控、膜的整体组分、酶及p53蛋白受体结合富集。KEGG通路分析显示URSA铁死亡基因富集最明显的为FoXO信号通路。采用String数据库及Cytoscape软件筛选出的URSA铁死亡关键基因分别为EGFR、SRC、KRAS、MDM2。RT-qPCR检测结果显示，EGFR、SRC、MDM2在URSA组中的表达均低于人工流产组（均P<0.05）;KRAS在URSA组和人工流产组中表达无统计学差异（P>0.05）。结论：铁死亡相关基因EGFR、SRC、MDM2可作为诊治URSA的潜在生物标志物。

关键词

不明原因复发性流产 / 铁死亡 / 差异表达 / 关键基因

基金资助

国家自然科学基金资助项目（No.81960281;No.82260306）; 广西重点研发计划项目资助（No.桂科AB20159031）