番茄DUF247基因家族全基因组鉴定

摘要

DUF247是一个保守的蛋白质结构域，编码含有此结构域的蛋白质在植物生长、发育及胁迫中发挥重要作用。研究鉴定了番茄基因组中26个DUF247基因家族成员，分别命名为SlDUF247-1～SlDUF247-26。对DUF247基因家族理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、系统进化关系、启动子顺式作用元件等进行生物信息学分析。结果表明：染色体分布说明番茄DUF247基因家族在结构和功能具有多样性。启动子顺式作用元件分析显示，番茄DUF247基因家族成员，可能参与非生物胁迫和植物生长发育等多种生物学过程。转录组数据显示，20个番茄DUF247家族成员能够抵抗干旱和冷胁迫。结果有助于揭示DUF247基因家族在番茄生长发育和逆境中的基因功能。

关键词

DUF247基因家族 / 番茄 / 生物信息学 / 基因功能