泛基因组学在番茄育种中应用的研究进展

王傲雪; 赵启悦; 崔雪

doi:10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2025.04.015

东北农业大学学报 ›› 2025, Vol. 56 ›› Issue (04) : 161 -170. DOI: 10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2025.04.015

泛基因组学在番茄育种中应用的研究进展

王傲雪, 赵启悦, 崔雪

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摘要

番茄（Solanum lycopersicum）是茄科植物中重要的模式作物，近年来，测序技术不断提升，促进基因组学在番茄育种中的应用，其中，涵盖物种全部遗传信息的泛基因组学正在推动番茄育种的新革命，其有效规避了单一参考基因组遗传变异较少的局限。虽然构建可作参考的泛基因组已成为重大挑战，但多种组装算法和流程的同步开发，逐渐让泛基因组的构建实现了高度连续和正确，为复杂农艺性状的解析提供准确的数据支撑。随着全球范围内被测序的番茄样本不断增加，高质量的番茄泛基因组及图泛基因组接连公开，极大助力了“基因型-表型-环境”三者之间的解析，加速番茄育种向4.0阶段迈进。研究回顾了泛基因组学在揭示野生番茄到栽培番茄的演化与驯化模式中的应用，总结了全基因组关联分析在辅助关键农艺性状基因定位中取得的成果。