番茄DUF966基因家族鉴定及表达

王傲雪; 郑佳新; 李丹; 张慧欣

doi:10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2025.06.002

东北农业大学学报 ›› 2025, Vol. 56 ›› Issue (06) : 16 -28. DOI: 10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2025.06.002

番茄DUF966基因家族鉴定及表达

王傲雪, 郑佳新, 李丹, 张慧欣

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摘要

DUF966基因家族是一类未知功能的基因家族，该基因家族在应对非生物胁迫及调节植物生长发育过程中发挥重要作用。根据Pfam数据库下载的DUF966(PF06136)隐马尔可夫模型序列，以拟南芥DUF966家族蛋白序列作为参考序列，从番茄基因组中鉴定DUF966基因家族成员；采用生物信息学方法，分析DUF966基因家族染色体定位、蛋白理化性质、保守基序、启动子顺式作用元件及miRNA和DUF966基因家族间的靶向关系。结果表明：从番茄全基因组中筛选鉴定出8个SlDUF966基因家族成员，根据染色体定位将其命名为SlDUF966-1～SlDUF966-8,SlDUF966基因家族启动子包含多种非生物胁迫抵抗元件。应用番茄相关非生物胁迫转录组数据及qRT-PCR结果分析发现，SlDUF966-5和SlDUF966-7可抵抗冷胁迫和盐胁迫。亚细胞定位表明，SlDUF966-5蛋白定位于细胞核、SlDUF966-7蛋白定位于细胞核和细胞膜。