猪诱导多能干细胞超级增强子注释分析

章露浩; 王惠; 李妍妍; 高圣玥; 郭媛媛; 王志鹏

doi:10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2026.01.010

东北农业大学学报 ›› 2026, Vol. 57 ›› Issue (01) : 100 -107. DOI: 10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2026.01.010

猪诱导多能干细胞超级增强子注释分析

章露浩, 王惠, 李妍妍, 高圣玥, 郭媛媛, 王志鹏

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摘要

为探究超级增强子对猪重要经济性状的相关遗传机制，利用猪诱导多能干细胞染色质免疫共沉淀测序（H3K27ac ChIP-seq）数据，系统预测并注释分布在猪基因组上的超级增强子。结果表明：在猪诱导多能干细胞中共预测到418个超级增强子，主要富集在启动子及基因密度较高的区域；靶基因预测结果表明，超级增强子相关靶基因与基因转录功能密切相关，其中，GATA基因家族结合基序在超级增强子区域高度聚集；影响猪重要经济性状的显著SNP位点与CpG岛均在超级增强子区域显著富集。