基于网络药理学、分子对接和分子动力学研究生脉散治疗肝纤维化的药理机制

摘要

目的 应用网络药理学、分子对接和分子动力学探究生脉散治疗肝纤维化（HF）的治疗作用及潜在机制。方法 利用TCMSP、BATMAN-TCM和SwissTargetPrediction数据库预测生脉散中的活性成分及其作用靶点；使用GeneCards、OMIM和TTD数据库预测HF的潜在治疗靶点；使用STRING数据库分析构建蛋白互作（PPI）网络，并进行GO功能和KEGG通路富集分析；使用Cytoscape 3.9.1软件构建生脉散治疗HF的“中药-成分-靶点”网络图。利用分子对接和分子动力学模拟方法对主要活性成分和核心靶点进行模拟。结果 筛选得到生脉散中48个成分及其作用靶点374个，与HF有213个交集靶点；PPI分析发现：AKT1、EGFR、STAT3、HSP90AA1、TNF等靶点是生脉散治疗HF的关键蛋白靶点；GO和KEGG富集分析发现：PI3K-AKT、MAPK、TNF等信号通路及乙型肝炎等疾病通路可能是生脉散抗HF的关键信号通路；通过构建“中药-活性成分-靶点”网络，发现麦冬酮A、甲基麦冬二氢高异黄酮B、N-反式阿魏酰酪胺、山奈酚、五味子酯乙等成分可能是生脉散中发挥药效的关键活性成分。分子对接结果显示：生脉散中的主要活性成分与关键蛋白靶点均能自发结合(结合能≤-6.0 kcal·mol^-1);分子动力学模拟提示：麦冬酮A和甲基麦冬二氢高异黄酮B与AKT1蛋白间的相互作用稳定。结论 通过网络药理学、分子对接和分子动力学探究生脉散治疗HF的潜在作用机制，为生脉饮的研究与开发提供了思路。

关键词

生脉散 / 肝纤维化 / 网络药理学 / 分子机制 / 信号通路 / 分子对接 / 分子动力学 / 蛋白相互作用