光倒刺鲃的生物学特性及比较基因组学分析

范紫嫣, 黄一鸣, 刘鑫, 袁昊, 林佳欣, 陈佐权, 简少卿, 张万昌

南昌大学学报(理科版) ›› 2025, Vol. 49 ›› Issue (6) : 629 -636.

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南昌大学学报(理科版) ›› 2025, Vol. 49 ›› Issue (6) : 629 -636. DOI: 10.13764/j.cnki.ncdl.2025.06.012

光倒刺鲃的生物学特性及比较基因组学分析

    范紫嫣, 黄一鸣, 刘鑫, 袁昊, 林佳欣, 陈佐权, 简少卿, 张万昌
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摘要

光倒刺鲃(Spinibarbus caldwelli)作为我国重要的淡水经济鱼类,因过度捕捞、生境退化及水利工程影响,其自然种群资源呈显著衰退趋势。基于形态学与生物化学方法,系统解析了光倒刺鲃的生物学特征。形态学分析表明:成鱼肌间骨可分为7类,总数介于104~115根,其中“Ⅰ”型占比最高,集中分布于尾部区域;躯干部以“卜”型与“Y”型为主。采用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测光倒刺鲃12种组织的乳酸脱氢酶(LDH)与酯酶(EST)同工酶活性,发现LDH和EST表达谱具有显著组织特异性,其中心脏、肝脏及肾脏组织酶带数量最多为7条,活性强度与功能需求高度相关,可作为种质鉴定的生化遗传标记。比较基因组学分析发现,在11种鱼类物种中,共鉴定出36 134个基因簇,其中包含995个重叠基因簇以及11 540个保守直系同源基因簇。结果表明,光倒刺鲃在进化过程中具有显著的物种特异性进化特征。基于光倒刺鲃的生物学特性,分析比较基因组学结果,结合同工酶表达谱等分子遗传标记,可更准确地评估光倒刺鲃亲本的遗传多样性,选择遗传背景丰富的亲本进行繁殖,提高后代的遗传多样性和适应性。

关键词

光倒刺鲃 / 同工酶 / 生长性状 / 肌间刺 / 比较基因组

Key words

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光倒刺鲃的生物学特性及比较基因组学分析[J]. 南昌大学学报(理科版), 2025, 49(6): 629-636 DOI:10.13764/j.cnki.ncdl.2025.06.012

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