基于PTK靶点的黄芪中黄酮化合物抗肿瘤筛选及活性研究

摘要

目的 运用计算机辅助药物设计对黄芪中黄酮类化合物的抗肿瘤活性进行筛选。方法 使用Sybyl软件Surflex-dock模块对小分子与蛋白酪氨酸激酶（protein tyrosine kinases, PTK）进行分子对接，通过Total Score函数分值判断配体分子结合能力，筛选活性化合物，根据Lipinski五法则，使用Swiss ADME预测所研究化合物的药动学特性，最后将筛选出的最优化合物与PTK进行分子动力学模拟及体外分子水平实验，利用分子对接分析化合物与PTK蛋白的相互作用模式。结果 筛选出的槲皮素具有最佳的药物样特性并进行分子动力学模拟，利用体外表面等离子共振法验证了化合物与PTK之间具有较高的结合能力，KD值为1.44×10^-6μmol·L^-1。分子对接显示，槲皮素中多个羟基结构与PTK的氨基酸残基以氢键结合。结论 筛选出黄芪中黄酮类化合物槲皮素的抑癌效果很可能通过抑制PTK的激活实现，槲皮素可作为先导化合物进行优化。

关键词

黄芪 / 槲皮素 / 蛋白酪氨酸激酶 / 分子对接 / 先导化合物

基金资助

安徽省高校自然科学研究项目(2024AH051790,2022AH052970)