基于UPLC-Q-TOF-MS联合网络药理学研究贯叶连翘抗SRAS-CoV-2的有效成分和作用机制

摘要

目的 基于超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱联用技术(UPLC-Q-TOF-MS)联合网络药理学及分子对接研究贯叶连翘抗严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SRAS-CoV-2)的有效成分和作用机制，为其药效物质研究提供一定的参考依据。方法 运用UPLC-Q-TOF-MS对贯叶连翘全草提取物进行化学成分的分析，根据化合物的一、二级质谱信息及相关参考文献进行比对，对贯叶连翘的化学信息进行快速识别;通过Sw iss ADM E和Sw iss TargetPrediction数据库筛选贯叶连翘的有效成分和相关靶点;利用Genecards数据库和venny 2.1平台获得SRAS-CoV-2疾病靶点和交集靶点，利用STRING在线分析平台和Cytoscape 3.7.2软件中构建药物-成分-靶点网络;通过Metascape数据库对靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and gnomes,KEGG)通路富集分析。运用M aestro 12.8软件将有效成分和ACE2蛋白和3CL水解酶蛋白进行对接，运用Pymol软件进行可视化分析。结果 共鉴定出化合物69个，主要包括黄酮类29个、萜类10个、卟啉类2个、香豆素类1个、其他类27个，其中有32个化合物可能作用于肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、AKT1抗原(重组蛋白)[AKT1 antigen(recombinant protein),AKT1]、白蛋白(albumin,ALB)、血管内皮生长因子(vascular endothelial grow th factor,VEGFA)、表皮生长因子受体(epidermal grow th factor receptor,EGFR)等关键靶点，富集于癌症信号通路、2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)信号通路、EGFR信号通路等。分子对接发现氢键链接、Pi-Pi键连接、疏水作用、盐桥是其主要作用的形式。结论 初步的揭示了贯叶连翘抗SRAS-CoV-2的有效成分和作用机制，为贯叶连翘抗SRAS-CoV-2疾病的进一步研究及药物开发提供科学依据。

关键词

贯叶连翘 / SRAS-CoV-2 / UPLC-Q-TOF-MS / 网络药理学 / 分子对接