基于优化的纽曼随机游走模型挖掘甘草中的重要靶蛋白

摘要

目的 利用优化的纽曼随机游走模型，挖掘甘草中常规拓扑分析方法容易忽视的重要靶蛋白。方法 模拟药物在体内吸收过程，构建了多层随机游走网络。收集甘草的成分、靶蛋白、通路和治疗疾病等信息，根据不同节点的特性，设置了不同的转移概率，并进行不同步长的游走。通过统计经过靶蛋白的游走次数作为衡量其重要性的依据，筛选出前15%的靶蛋白，并与归一化拓扑模型、MRWBC模型进行比较，最终得到待验证的候选靶蛋白。结果 经过优化后的ARWBC模型，在众多候选靶蛋白中筛选出了9个潜在的靶蛋白，其中经过文献和分子对接验证了6个靶蛋白(CD40LG、IFNG、PRKCB、IGF2、E2F1、TGF1B)。结论 优化后的纽曼随机游走模型挖掘出了甘草中重要的靶蛋白，这些候选靶蛋白的转录活性，以期为甘草作为未来方剂的药理学研究提供有力的理论基础。

关键词

随机游走 / 甘草 / 靶蛋白 / 复杂网络