利用免疫评分筛选肺腺癌中有预后评估价值的基因

摘要

目的 基于ESTIMATE算法(一种使用基因表达特征来推断肿瘤样本中基质细胞和免疫细胞的比例的方法)筛选肺腺癌中有预后评估价值的基因。方法 将TCGA(肿瘤基因组图谱)数据库中的肺腺癌病例按照其免疫/基质评分分为高、低两组，并鉴定出与肺腺癌患者预后显著相关的差异表达基因。通过g:profiler数据库对有效靶基因进行GO(基因本体)富集分析。用GEO(基因表达综合数据库)数据集验证这些基因后采用实时定量PCR(聚合酶链式反应)验证。结果 高免疫评分的肺腺癌患者的总生存期长于低免疫评分，GO富集分析显示84个预后相关的差异表达基因主要与免疫系统进程有关，GEO数据库进一步验证了4个与预后相关的差异表达基因(DSE、EMR2、FLT3、GFPT2)。实时定量PCR结果显示在肺腺癌细胞中DSE、EMR2、GFPT2显著高表达，FLT3显著低表达。结论 DSE、EMR2、GFPT2、FLT3与肺腺癌患者的预后相关。

关键词

肺腺癌 / 肿瘤微环境 / 预后 / 预测 / 免疫评分