基于生物信息学分析KDM1A在肝癌中表达和下游分子调控机制

摘要

目的 分析KDM1A对于肝癌预后的意义及其潜在调控机制。方法 利用GEPIA、HPA网站进行KDM1A的表达分析和生存分析；使用linkedomics网站对KDM1A的相关性基因进行分析以及富集分析，RT-qPCR以及蛋白印迹实验检测肝癌细胞中KDM1A的表达情况，慢病毒转染构建KDM1A敲低细胞系，RT-qPCR实验验证敲低细胞系的成功构建，使用RT-qPCR实验检测细胞中MRTO4以及CCPG1的表达情况。结果 KDM1A在肝癌组织和肝癌细胞中呈现高表达，并与更短的总生存时间以及无病生存时间相关；KDM1A相关性基因主要在细胞代谢以及基因转录等过程富集，其中正相关基因以MRTO4为主，负相关基因以及CCPG4为主；肝癌细胞中敲低KDM1A后MRTO4表达下降，CCPG1表达增加。结论 KDM1A在肝癌中高表达，与预后不良相关；KDM1A正向调控MRTO4表达，负向调控CCPG1表达。

关键词

生物信息学 / KDM1A / MRTO4 / CCPG1 / 肝癌