基于生物信息学筛选胃出血和食道出血患者外周血特异性miRNA

摘要

目的 筛选并验证胃出血和食道出血患者外周血特异性miRNA。方法 基于转录组测序筛选胃出血和食道出血患者血清中差异表达miRNA,进一步采用韦恩分析筛选胃出血和食道出血患者血清中特异性miRNA。RT-qPCR检测上述筛选的miRNA在胃出血和食道出血患者血清样本中表达情况。结果 胃出血患者血清中共筛选1232个差异表达miRNA,其中1226个上调且6个下调。食管出血患者血清中共筛选1062个差异表达miRNA,其中967个上调且95个下调。筛选胃出血患者血清中特异性miRNA 65个，差异表达倍数前五分别为hsa-miR-3192-5p、hsa-miR-8060、hsa-miR-4635、hsa-miR-3936和hsa-miR-4436b-3p。筛选食道出血患者血清中特异性miRNA 7个，差异表达倍数前五分别为hsa-miR-139-3p、hsa-miR-4721、hsa-miR-6796-5p、hsa-miR-1185-2-3p和hsa-miR-7106-5p。RT-qPCR检测结果与上述分析结果一致。结论 筛选的胃出血和食道出血患者血清中特异性miRNA可作为辅助不同部位上消化道出血早期诊断的非侵入性标志物。

关键词

胃出血 / 食道出血 / 微小RNA / 生物信息学

基金资助

邢台市重点研发计划项目(2022ZC 075)