PDF
摘要
目的 探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)中肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)的作用及关键的LR对及其对预后的影响,以深入理解ESCC的预后机制。方法 基于TCGA-ESCC数据集,通过对单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)数据的分析,研究了ESCC样本中的关键基因表达和细胞类型相互作用。研究基于16种LR的表达,将79个ESCC样本分为两组,并通过Lasso分析识别出关键基因。进一步,本研究通过分析GSE154763数据集,揭示了ESCC的细胞类型和相互作用。结果 通过Lasso分析,识别出IL1A、LAMA3、TMEM45A和IGF2BP2四个关键基因,这些基因对ESCC生存有显著影响,并据此构建了有效的预后模型。通过进一步分析GSE154763数据集,鉴定出19个簇和10种细胞类型,发现4种细胞群体在ESCC与正常组织中的表达差异显著。结论 本研究通过分析单细胞RNA和TCGA-ESCC数据,揭示了ESCC中关键的LR和细胞亚群。我们构建的基于四个基因的预后模型显示出优异的预测能力,为ESCC的治疗提供了新的生物标志物和潜在治疗靶点。
关键词
食管鳞状细胞癌
/
配体
/
受体
/
单细胞RNA测序
/
细胞通讯
/
预后
Key words
生物信息学方法解析食管鳞状细胞癌中的配体-受体相互作用图谱和预后影响[J].
胃肠病学与肝病学杂志, 2024, 33(05): 532-538 DOI: