基于数据库对结肠癌预后模型的构建与临床验证

摘要

目的 运用生物信息分析的方法寻找新的靶向基因预测结肠癌的预后情况，为结肠癌的诊断及临床治疗提供新的思路。方法 通过对GEO和TCGA数据库联合分析差异基因，进行富集通路后绘制蛋白网络互作图筛选关键基因。验证集验证关键基因表达情况，行Cox回归生存分析，ROC评估关键基因对结肠癌的诊断和预后预测能力，绘制列线图模型。免疫组化验证关键基因的表达情况，分析其与临床预后情况。结果 共有293个差异基因，可能参与Wnt/β-cantenin通路、PPAR通路和趋化因子相关的炎症信号通路等，进一步筛选出包含ITM2C、LRRC19、C1orf115、TMEM236等4个基因的模块，Cox回归分析发现ITM2C是结肠癌的独立预后因素，ITM2C高表达的患者具有更好的总体生存期(P<0.05)。ROC曲线显示ITM2C基因对结肠癌有较好的诊断能力(AUC=0.983),1、3、5年时间依赖ROC曲线下面积分别为0.54、0.54、0.65。构建了ITM2C相关的生存预测模型，校准曲线显示该模型有较好的预测能力。免疫组化验证了ITM2C在结肠癌组织中低表达(P<0.05),生存分析证实了ITM2C高表达组的生存优于低表达组。结论 ITM2C在结肠癌组织中低表达，且影响患者预后，该基因可作为结肠癌诊断和预后评估的潜在靶点。

关键词

整合蛋白2C / 结肠癌 / 肿瘤靶点 / 预后