基于生物信息学对比分析高脂饮食和蛋氨酸胆碱缺乏饮食构建的非酒精性脂肪性肝病小鼠模型

摘要

目的 比较高脂饮食(high-fat diet, HFD)饮食和蛋氨酸胆碱缺乏(methionine-choline-deficient, MCD)饮食对C57小鼠非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease, NAFLD)模型的影响，通过生物信息学方法揭示其差异表达基因(GEO-data-based analysis of differentially expressed genes, DEGs)并进行功能分析。方法 从GEO数据库中获取GSE78170、GSE123354的表达数据。使用R语言分别比较C57小鼠对照组与MCD饮食组、C57小鼠对照组与HFD饮食组数据获得DEGs。对DEGs进行进一步的差异分析、功能富集分析、构建基因和蛋白互作网络及重叠DEGs对比分析。结果 筛选出HFD诱导的上调基因44个，下调基因16个；MCD诱导的上调基因43个，下调基因73个；分析富集分析排名前12位的生物学过程，提示HFD与肝脏单纯脂肪积累相关，MCD则能全方位促进NAFL进一步转变为NASH。结论 HFD诱导的基因主要涉及肝脏脂肪积累，而MCD更倾向于全方位促进NAFL向NASH的进展。

关键词

非酒精性脂肪性肝病 / 蛋氨酸胆碱缺乏 / 高脂饮食 / 生物信息学分析