基于16S rRNA基因测序技术分析急性肝内胆汁淤积大鼠的肠道菌群

摘要

目的 探讨ANIT诱导的大鼠急性肝内胆汁淤积（acute intrahepatic cholestasis, AIC）与肠道菌群的关系。方法 以SPF级的SD大鼠为实验对象，随机分为正常对照组、模型组，每组24只，依据取材时间不同又将各组随机分为24 h、48 h、72 h 3个亚组，每组8只。模型组通过一次性予2%ANIT按100 mg·kg^-1·d^-1灌胃造模诱发AIC模型，正常对照组予等容积色拉油灌胃。通过高通量测序法对肠道粪便细菌16S rRNA的V₃～V₄区进行基因测序及生物信息学分析。结果 AIC造模后，随着时间增加，α多样性指数逐步升高，造模72 h组相比造模24 h组，Shannon指数有显著性差异；β多样性发现，利用基于加权Unifrac距离PcoA分析或NMDS分析均显示：正常对照组、造模24 h组和造模48 h组的肠道菌群显示比较明显的聚集效应；在门水平上，厚壁菌门（Firmicutes）丰度在造模48 h后显著下降，变形菌门（Proteobacteria）的丰度显著上升，拟杆菌门（Bacteroidetes）的丰度显著上升；LEfSe对组间差异显著的物种分析结果显示，LDA值大于4的微生物类群有35个。结论 模型组干预后大鼠肠道菌群结构和多样性均发生显著变化。

关键词

急性肝内胆汁淤积 / 大鼠 / 16S rRNA基因测序技术 / 肠道菌群

基金资助

首都医科大学附属北京中医医院中医药学科建设项目-中医肝病学; 首都医科大学临床专科学院(系)培养基金开放课题(CCMU2022ZKYXZ008); 首都卫生发展科研专项项目(首发2018-2-2173); 北京市属医院科研培育计划项目(PZ2018023)