基于生物信息学分析鉴定酪氨酸激酶受体EphB4为肝细胞癌血管生成的关键基因

摘要

目的 基于生物信息学分析EphB4在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)中的表达及作用，进一步探讨EphB4在HCC血管生成中的作用。方法 收集UALCAN数据库中EphB4在HCC中的研究信息，并分析EphB4的表达水平与HCC患者临床病理指标相关性。利用Genecards数据库分析EphB4蛋白富集的功能以及相关的蛋白，并应用String构建EphB4共表达蛋白网络图，DAVID对EphB4共表达蛋白网络进行功能富集和KEGG分析。进一步通过免疫组化验证EphB4在HCC组织中的表达，并分析EphB4与HCC组织内皮细胞标志物(CD31)和HCC组织微血管密度(microvascular density, MVD)的关系。结果 EphB4在HCC组织中明显高表达(P<0.05),HCC中异常高表达的EphB4与HCC的病理分期相关(P<0.05)。通过Genecards分析，发现EphB4的功能主要富集血管的萌芽和新生、细胞发育和迁移、轴突的引导、蛋白的磷酸化等。通过String数据库发现10个与EphB4密切相关的蛋白，进一步通过DAVID数据库对EphB4共表达蛋白进行GO分析，发现功能主要富集在细胞的运动、血管的萌芽和生成、信号通路的激活、细胞骨架形成、T细胞的调节等；参与的通路为轴突传递、Ras系统、Ephrin信号系统、VEGF信号通路、PI3K-AKT信号通路等。免疫组化结果表明EphB4在HCC中高表达，EphB4表达水平与CD31的表达水平呈正相关(R=0.85,P<0.0001);EphB4高表达的HCC组织中MVD计数明显增加(P<0.0001)。结论 EphB4在HCC组织中高表达，并参与调节HCC组织的血管生成。

关键词

酪氨酸激酶受体EphB4 / 肝细胞癌 / 生物信息学 / 血管生成