通过RNA-seq探究外源性硫化氢对肝癌细胞系HepG2的影响

摘要

目的 探究外源性硫化氢（hydrogen sulfide, H₂S）对肝细胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）的影响及可能的分子机制，为HCC诊疗提供理论实验支持。方法 从GEO数据库中获取HCC的基因表达数据，并筛选外源性H₂S处理HepG2细胞的RNA-seq数据，通过差异基因筛选、GO和KEGG通路分析，确定H₂S调控的主要生物学功能和信号通路。结果 数据分析表明，与正常组织相比，肝癌组织中硫化氢合成关键酶胱硫醚γ裂解酶（cystathionine γ-lyase, CSE）和胱硫醚合成酶（cystathionine β-synthase, CBS）的表达显著下降。筛选出3 640个差异基因，其中317个与细胞衰老、580个与细胞增殖、43个与凋亡相关。通过蛋白互作网络分析，Jun、MAPK1和MAPK3等关键基因被识别，提示H₂S可能通过调控Jun/MAPK信号通路影响HCC的发生发展。结论 H₂S在HCC中可能通过Jun/MAPK通路发挥的调控作用，为H₂S在HCC中的分子机制研究和潜在治疗应用提供了基础。

关键词

硫化氢 / 肝细胞癌 / 转录组学

基金资助

北京市高层次公共卫生技术人才建设项目(02-19); 北京市医院管理中心青年人才培养“青苗”计划(QML20211701); 首都医科大学附属北京佑安医院中青年人才培养计划专项经费资助(YARCKB20222003)