基于宏基因组学分析结直肠癌患者化疗耐药与肠道菌群的关系

摘要

目的 基于宏基因组学分析结直肠癌患者化疗耐药与肠道菌群的关系。方法 选取2021年9月至2023年3月入院就诊的150例结直肠癌患者为研究对象，另选取150名健康者为健康组。根据结直肠癌组患者化疗敏感情况将150例患者分为敏感组(n=82)和不敏感组(n=68),通过宏基因组测序，分析两组的OTU菌群丰度、α-多样性、β-多样性、差异性菌种、差异性耐药基因。通过相关性分析判断肠道菌群变化与耐药基因之间的相关性。结果 结直肠癌组的OTU菌群丰度、α-多样性、β-多样性均低于健康组。不敏感组的OTU菌群丰度、α-多样性、β-多样性均低于敏感组。结直肠癌组与健康组之间共有24个差异性菌种，其中6个菌种在结直肠癌患者肠道中显著富集，18个菌种在结直肠癌组中显著降低；不敏感组与健康组相比，6个菌种明显富集。结直肠癌组和健康组在13种耐药基因间存在显著性差异，且全部在结直肠癌组肠道中富集，不敏感组肠道中13种耐药基因富集显著高于敏感组。对结直肠癌组和健康组的差异性肠道菌种与耐药基因进行相关性分析，6个差异性菌种分别与13种耐药基因呈正相关。结论 结直肠癌患者肠道菌群丰度明显降低，部分菌群与化疗敏感性存在密切关系，与耐药基因呈显著正相关。

关键词

结直肠癌 / 化疗耐药 / 肠道菌群 / 影响因素

基金资助

广东省医学科学技术研究基金项目(A2022452); 广东省基础与应用基础研究基金(2022A1515220076)