基底膜相关基因在结肠癌患者的临床预后风险评分和免疫特征

摘要

目的 探讨基底膜相关基因(basement membrane related genes, BMRGs)在结肠癌的临床预后和免疫特征。方法 从文献中收集了222个BMRGs,在TCGA队列应用LASSO-Cox回归方法建立风险评分模型，并使用GSE87211队列验证。此外，构建包含BMRGs风险评分和临床因素的列线图预测结肠癌患者的生存预后。最后，评估风险评分亚组的蛋白功能富集状态、免疫浸润水平、药物敏感性分析和单细胞表达情况。结果 9个BMRGs构建的风险亚组与结肠癌患者的预后高度相关(P<0.001)。其中ADAMTS4、GPC2、UNC5A、ITGA7、LAMA2、PODN是预后不佳因素，ADAMTS8、UNC5D、MMP1是预后保护因素。整合BMRGs风险评分、TNM肿瘤分期和患者年龄的列线图有助于提高预后不良患者的识别效率。蛋白功能分析显示高风险组的上调基因富集于Hedgehog信号通路并参与上皮-间充质转化；相较于高风险组，低风险组免疫细胞浸润程度更高；药物敏感性分析显示，高风险组患者对AZD7762、Wee1激酶抑制剂的敏感性较高；低风险组患者对SB505124的敏感性较高；单细胞分析显示：GPC2、ADAMTS4、PODN、LAMA2、ITGA7基因在结肠癌的肿瘤细胞中均存在高表达。结论 本研究建立并验证了基于BMRGs的风险评分模型，为预测结肠癌患者的预后状态提供了一项有效的临床参考指标。

关键词

基底膜相关基因 / 结肠癌 / 预后模型 / 列线图 / 生物信息学

基金资助

国家自然科学基金青年项目(82102805); 湖南省自然科学基金项目(2024JJ7594)