基于16S rDNA基因测序技术探索肝硬化患者的肠道菌群特征

摘要

目的 通过比较肝硬化患者与健康志愿者的肠道菌群特征，探索肝硬化患者与健康人群的肠道菌群差异及关联。方法 选取2023年2月至2023年8月就诊于云南省第三人民医院的37例肝硬化患者(包含乙肝肝硬化11例，酒精性肝硬化12例，其他病因所致肝硬化14例),以及同期37名健康志愿者。收集研究对象的新鲜粪便样本，采用16S rDNA高通量测序技术检测肠道菌群，进行菌群多样性及组成分析。结果 肝硬化患者与健康志愿者的肠道菌群在丰富度、均匀度及群落结构上均有差异。而同处于肝硬化阶段，乙肝肝硬化与酒精性肝硬化菌群特征比较，差异有统计学意义(P<0.05)。此外，LEfSe分析显示，肝硬化组优势菌属为链球菌属(Streptococcus)和大肠杆菌—志贺菌属(Escherlchia＿Shigella)。PICRUSt分析显示，肝硬化组细菌的膜转运、碳水化合物代谢、聚糖生物合成和代谢功能基因含量高于健康对照组，差异有统计学意义(P<0.05)。结论 肝硬化患者与健康志愿者相比，具有显著差异的肠道菌群特征，其中Streptococcus和Escherlchia＿Shigella作为肝硬化患者属水平上的优势菌属，其可能成为诊断肝硬化的生物学标志物；肝硬化患者肠道菌群特征改变可能导致基因功能变化，从而促进肝硬化发生、发展。

关键词

肝硬化 / 肠道菌群 / 16S rDNA测序 / LEfSe分析 / 菌群功能预测

基金资助

云南省高层次科技人才及创新团队选拔专项-中青年学术和技术带头人后备人才项目(202405AC350067); 云南省教育厅科学研究基金项目(2024Y919)