A4gnt基因敲除小鼠胃菌群特征分析

摘要

目的 分析A4gnt基因敲除(knockout, KO)小鼠胃癌发生过程中的胃黏膜菌群紊乱特征。方法 8～10周龄SPF野生型C57BL/6N小鼠5只和A4gnt KO小鼠10只，喂养20周后处死。解剖后取胃黏膜组织分别进行组织病理学分析以及16S扩增子高通量测序分析。结果 组织病理学分析显示，A4gnt KO小鼠胃黏膜肿瘤组织的黏膜厚度及上皮细胞数量显著增加，其胃癌前病变及胃癌的发生率均为40%。高通量测序结果显示，A4gnt KO小鼠胃菌群Chao1指数及Shannon指数明显高于C57BL/6N小鼠(P<0.05),PCoA分析显示两组小鼠菌群结构可以相互区分(P=0.007)。共现性网络分析显示A4gnt KO小鼠胃细菌间的相互关系更加复杂，相互作用强于C57BL/6N小鼠。LEfSe分析鉴定出6个在A4gnt KO小鼠中相对丰度升高的菌属(LDA值≥2.0,Alloprevotella、Alistipes、Clostridia＿vadinBB60＿group、Desulfovibrio、Blautia和Oscillibacter)。PICRUSt2功能预测分析显示，A4gnt KO小鼠有9条有关糖代谢功能注释差异(P<0.05)。结论 A4gnt KO小鼠胃癌发生过程中胃黏膜组织出现了明显的炎症反应及胃癌病理改变，其胃菌群丰富度、多样性增加，结构明显发生改变，并且发生糖代谢紊乱，为进一步探索胃菌群促进胃癌发生的机制提供理论依据。

关键词

胃癌 / 胃菌群 / A4gnt基因 / 功能预测 / 共现性网络