幽门螺杆菌 SNP20253与胃癌发生相关性的研究

摘要

目的 探究幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,H.pylori）SNP20253与胃癌发生的相关性。方法 将H.pylori 120株分成两组，其中胃癌组47株，非胃癌组73株。将上述菌株进行复苏及DNA提取，采用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱检测技术（matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF）进行单核苷酸多态性分型，利用χ²检验进行统计学分析分析H.pylori SNP20253位点的多态性。在GenBank数据库1 022株菌株中进一步验证该位点与胃癌的相关性。利用TreeBest软件对上述菌株的全基因组序列构建Neighbour-Joining系统进化树，在各个亚群中进一步验证上述相关性。选取6株H.pylori菌株并平均分成含风险碱基C组（C组）和含正常碱基T组（T组）,构建H.pylori与胃上皮细胞AGS细胞共培养模型，利用尿素酶比色法进行黏附实验并利用qRT-PCR和ELISA方法探究该位点多态性对胃上皮细胞IL-8和TNF-α表达的影响。结果 在120株临床菌株中，SNP20253位点风险碱基C在胃癌组和非胃癌组的频率分别为61.7%和41.1%,差异有统计学意义（χ²=4.858,P=0.028;OR=2.309）。在GenBank数据库1 022株菌株中，该位点风险碱基C在胃癌组和非胃癌组的频率分别为43.1%和33.9%,差异有统计学意义（χ²=7.023,P=0.008;OR=1.479）。在hpEastAsia亚群218株菌株中，该位点风险碱基C在胃癌组和非胃癌组的频率分别为46.3%和32.1%,差异有统计学意义（χ²=4.021,P=0.039;OR=1.789）。体外实验结果显示，与T组相比，C组菌株对胃上皮细胞的黏附能力，诱导IL-8、TNF-α的表达水平均无显著变化。结论 携带SNP20253的H.pylori菌株与胃癌发生风险显著相关，该SNP位点对预测胃癌发生风险有潜在价值。

关键词

幽门螺杆菌 / 单核苷酸多态性 / 胃癌 / IL-8 / TNF-α