宏基因二代测序在终末期肝病合并肺部感染病原学诊断的价值

摘要

目的 探讨宏基因二代测序(metagenomics next-generation sequencing, mNGS)技术在终末期肝病(end-stage liver disease, ESLD)合并肺部感染病原学诊断中的应用价值。方法 收集2022年1月至2024年8月在我院确诊为ESLD合并肺部感染患者86例的临床资料，男59例，女27例，年龄(62.50±15.50)岁。纳入研究的86例患者中，有80例确定病原学，按照感染程度将患者分为重症组(n=42)和非重症组(n=38),并采用SPSS 23.0统计软件进行数据统计分析。结果 (1)传统病原学检测结果，细菌方面共检测出8种菌属，真菌中只检测出1种菌属。(2)mNGS检测结果，细菌方面共检测出17种菌属，真菌方面共检测出3种菌属，特殊病原体方面共检测出2种菌属，病毒方面共检测出4种菌属。(3)mNGS检测的阳性率显著高于其他检测方法(P<0.05)。(4)mNGS与传统病原体培养检测、PCR检测、总体传统微生物检测相比临床诊断结果一致性较高。(5)对重症和非重症患者的临床特征进行比较，结果发现，两组患者在性别、白细胞计数、中粒细胞百分比、中粒细胞计数、血小板计数、C反应蛋白、谷丙转氨酶、谷草转氨酶、尿素氮、肌酐比较，差异均有统计学意义(P<0.05)。(6)两组患者在单纯感染和混合感染比较，差异均有统计学意义(P<0.05)。在混合感染中，细菌病毒真菌混合感染在重症患者中的比例显著高于非重症患者(P<0.05)。(7)42例重症患者在细菌属水平共检测出17种，真菌属水平检出3种，病毒检测出4种。细菌类病原菌中，假单胞菌属、克雷伯氏菌属和不动杆菌属最为常见，占比分别为42.86%、38.10%、33.33%;真菌类病原菌中，曲霉属和肺孢子菌属占比较高，占比分别为30.95%、16.67%;病毒类病原菌中，淋巴隐病毒属和玫瑰疹病毒属较为常见，占比分别为26.19%、21.43%。(8)确定病原体的80例患者，增加抗生素种类的患者为21例(48.83%)、更换抗生素种类6例(13.95%)、抗生素选用未做调整16例(37.21%)。临床结局中，重症组好转14例，病情恶化(死亡及因病危自动出院)12例，非重症组好转出院15例，病情恶化2例。结论 mNGS方法检测所需时间较少、阳性率较高，且在ESLD合并感染病原学诊断中具有较高的敏感性和准确性，展现出重要的临床应用价值。

关键词

宏基因二代测序 / 终末期肝病 / 合并肺部感染 / 价值

基金资助

广东医科大学青年科研培育基金(GDMUQ2022024)