基于网络药理学及分子对接探讨大柴胡汤治疗坏死性肠炎的作用机制

摘要

目的 利用网络药理学及分子对接方法，系统探讨大柴胡汤治疗坏死性肠炎的潜在作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)筛选大柴胡汤的药物活性成分及其作用靶蛋白，将筛选出的靶蛋白与UniProt数据库进行匹配得到大柴胡汤有效成分作用靶基因。通过Gene Cards、OMIM、Malacards数据库韦恩交集获得坏死性肠炎核心疾病基因，将核心疾病基因与有效成分作用靶基因进行韦恩交集，得到大柴胡汤-坏死性肠炎交集核心靶点。利用STRING平台，通过Cytoscape 3.10.1软件构建PPI网络，筛选大柴胡汤的核心靶点蛋白，并构建“药物-有效活性成分-靶点基因”网络图，确定大柴胡汤的主要有效活性成分。对于交集核心靶点进行GO分析和KEGG富集分析，揭示大柴胡汤治疗坏死性肠炎的关键通路。最后通过Autodock软件进行分子对接验证。结果 大柴胡汤方剂中的6味中药(柴胡、黄芪、白芍、半夏、枳实、大黄)共筛选出56种有效活性成分和192个作用靶点，与坏死性肠炎共有交集核心靶点87个。根据PPI网络分析和药物-有效活性成分-靶点基因网络，筛选出大柴胡汤治疗坏死性肠炎的主要有效活性成分包括：槲皮素(quercetin)、木犀草素(luteolin)、异鼠李素(isorhamnetin)、山奈酚(kaempferol)、黄芩素(baicalein)等，主要交集靶点基因包括IL6、MAPK3、PTGS2、IL1B、CASP3等。GO富集分析显示交集核心靶点基因的功能主要包括对细菌来源分子的反应、对脂多糖的反应、对类固醇激素的反应、对活性氧的反应、对氧气水平降低的反应、腺体发育、膜微区、质膜外侧、DNA结合转录因子结合、泛素样蛋白连接酶结合等。KEEG分析显示交集核心靶点基因涉及的信号通路主要包括以下通路：脂质与动脉粥样硬化通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、NF-κB信号通路等分子机制。分子对接结果表明，除了异鼠李素与IL1B无法结合以外，异鼠李素与其他核心蛋白之间、其他大柴胡汤有效成分(槲皮素、木犀草素、山奈酚、黄芩素)与核心蛋白之间有着良好的结合稳定性。结论 大柴胡汤方剂通过多成分、多靶点、多通路协同发挥对坏死性肠炎的治疗作用，其中抗氧化、抗炎机制值得进一步研究。

关键词

网络药理学 / 分子对接 / 大柴胡汤 / 坏死性肠炎