基于特定溶质载体蛋白相关基因构建结直肠癌预后风险模型

摘要

目的 构建基于特定溶质载体蛋白(solute carrier protein, SLC)基因的预后特征模型，并探究其在结直肠癌(colorectal cancer, CRC)中的生物学功能。方法 从GEO(GSE39582)和TCGA数据库获取CRC队列的转录组数据及临床信息。经数据集整合与批次效应校正后，样本被随机分为训练集与验证集。通过单因素与多因素Cox回归分析提取SLC基因表达矩阵并构建预后模型。根据风险评分将患者分为低危组与高危组，进一步对生存结局、转录组特征、临床病理参数、免疫浸润模式进行系统性比较分析。此外，通过实验验证基因表达水平并利用功能缺失实验评估SLC11A1的生物学功能。结果 本研究成功构建了包含9个SLC基因的预后风险模型。高危组患者总生存期显著降低且病理分期更晚。值得注意的是，高危亚组富集肿瘤进展相关通路，免疫细胞浸润水平升高。关键基因SLC11A1在结肠癌HCT116细胞中高表达(实验验证)。体外敲低SLC11A1可显著抑制结肠癌细胞的增殖与迁移能力。结论 SLC11A1可能成为CRC的靶向治疗新靶点。

关键词

溶质载体家族 / 结直肠癌 / 预后模型 / SLC11A1 / 免疫浸润

基金资助

江苏省科研与实践创新计划项目(SJCX24-1543)