天祝白牦牛全线粒体基因组母系遗传多样性

摘要

为从基因组水平上揭示天祝白牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构和母系遗传背景，本研究利用基因组重测序技术，测定42头天祝白牦牛的全基因组序列，获取其线粒体基因组全序列，并从GenBank中下载1条已公布的天祝白牦牛线粒体基因组全序列，对共计43条天祝白牦牛线粒体基因组全序列进行综合分析。结果表明：从43条天祝白牦牛线粒体基因组全序列中共识别出971个变异位点，包括25个单一多态位点和946个简约信息位点；通过序列间核苷酸变异确定了20种单倍型，单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.907和0.013，表明天祝白牦牛拥有较为丰富的母系遗传多样性。与野牦牛及环湖、雪多、玉树、青海高原、帕米尔等牦牛品种相比，天祝白牦牛母系遗传多样性相对较低。利用美洲野牛作为参考外群进行系统发育分析，20种单倍型分布于5种单倍型组（A、B、C、E和G）中，归属于3个母系遗传支系（Mt-Ⅰ、Mt-Ⅱ和Mt-Ⅲ），以Mt-Ⅰ支系为主，推测其有3个母系起源。

关键词

天祝白牦牛 / 线粒体基因组 / 遗传多样性 / 群体结构 / 系统发育