水母雪兔子SmGPAT13基因克隆与表达分析

摘要

甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosph ate acyltransferase, GPAT)在植物角质层形成方面具有重要作用。为探究高山植物水母雪兔子(Saussurea medusa)角质层的形成机制，以水母雪兔子为材料，采用RT-PCR技术克隆了与角质层形成相关的GPAT基因，并对其进行生物信息学分析和不同组织(根、茎、叶和花)qRT-PCR的表达量验证。结果表明：克隆得到的SmGPAT13基因含有GPAT家族特征性酰基转移酶结构域(PlsC),cDNA全长序列为1 497 bp,可编码498个氨基酸；该蛋白相对分子质量为55.68 kDa,等电点为8.96,蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主；系统发育树分析表明，SmGPAT13蛋白与菊科小蓬草(Erigeron canadensis)蛋白的亲缘关系最近，且归属于GPAT6亚家族；启动子区顺式作用元件预测发现，SmGPAT13基因的启动子区含有逆境胁迫、生长发育、激素和光响应相关的顺式作用元件；qRT-PCR结果表明，SmGPAT13基因在不同组织中均有表达，且在花中相对表达量最高。本研究可为进一步探究水母雪兔子SmGPAT13基因功能提供理论依据。

关键词

水母雪兔子 / SmGPAT13 / 基因克隆 / 表达分析