青海茄参McCCoAOMT基因的克隆及其在冷胁迫下的表达分析

摘要

为探究冷胁迫条件下青海茄参McCCoAOMT基因的调控机理，利用RT-PCR技术克隆该基因，并对其进行生物信息学及冷胁迫表达分析。结果表明：（1）McCCoAOMT为典型的腺苷三磷酸转移酶，是AdoMet-MTases基因家族中的一员。青海茄参McCCoAOMT基因的开放阅读框（ORF）长度为216 bp,编码71个氨基酸。（2）青海茄参与其他12个物种的CCoAOMT蛋白均包含保守的SAM结构域。青海茄参McCCoAOMT蛋白与番茄（NP＿001234801.1）CCoAOMT蛋白的亲缘关系最近。（3）青海茄参McCCoAOMT蛋白的分子式为C₃₄₀H₅₅₆N₉₀O₁₀₆S₆,分子量为7 793.05 Da,理论等电点为8.03（>7）;McCCoAOMT为稳定亲水性蛋白，其亚细胞定位于细胞质中，以无规则卷曲与α-螺旋作为二三级的主要结构；McCCoAOMT蛋白无跨膜结构，无信号肽，含有5个丝氨酸、2个苏氨酸和0个酪氨酸位点。（4）在冷胁迫条件下，青海茄参叶片中的McCCoAOMT基因表达量呈先上升后下降再上升的趋势，在处理24 h时其相对表达量达到最高。研究结果可为进一步探究青海茄参的耐寒分子机制提供一定的数据参考。

关键词

青海茄参 / 基因克隆 / 表达分析 / 咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶